1. 作物生产研究室:
(1)作物新品种引种、鉴定、筛选与推广;
(2)新技术、新产品引进与组装配套技术;
(3)现代高效农业生产技术规程;
(4)农产品安全生产环境综合控制技术;
2. 畜产技术研究室:
(1)现代高效畜牧生产技术;
(2)动物营养与绿色饲料资源开发利用;
(3)畜禽新品种引进与优秀地方良种选育;
(4)畜禽常见病综合防治技术;
(5)重大动物疫病防空技术。
3. 园艺与林业技术研究室:
(1)林业生产及园林设计在环境保护和维护生态动态平衡中的应用技术;
(2)果树新品种的引种、优育及果树生产、果品保鲜、贮藏、加工技术;
(3)秦巴山区经济林资源开发利用和高效生产模式;
(4)花卉生产新技术的研究和推广,野生花卉资源的开发利用,盆景制作、鲜、切花生产技术;
(5)草坪生产和养护管理技术;
(6)园林设计和工程技术。
4. 环境生态研究室:
土壤环境、水环境质量及食品安全
5. 秦巴资源开发利用研究室:
(1)秦巴山区药用植物资源普查;
(2)利用分子遗传学方法建立中草药评价系统;
(3)中药材次生代谢调控研究;
(4)核心种质资源的人工栽培与组织培养;
(5)秦巴山区药用植物不同用途的开发。